nf-core-marsseq:基于 Nextflow 的 MARS-seq v2.0 单细胞预处理流程项目

可用于 MARS-seq v2.0 实验的单细胞生物信息学预处理,支持结合 FACS 研究稀有细胞群体,核心功能包括 FASTQ 转 10X v2 格式及基于 StarSolo 的 RNA velocity 分析,还能从 GENCODE 数据库下载并生成含 ERCC spike-ins 的基因组参考。【此简介由AI生成】

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项目介绍

可用于 MARS-seq v2.0 实验的单细胞生物信息学预处理,支持结合 FACS 研究稀有细胞群体,核心功能包括 FASTQ 转 10X v2 格式及基于 StarSolo 的 RNA velocity 分析,还能从 GENCODE 数据库下载并生成含 ERCC spike-ins 的基因组参考。【此简介由AI生成】

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